MADRID 18 Nov. (EUROPA PRESS) -
El Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH-1 cuya responsable es la doctora África Holguín, y que pertenece al Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Ramón y Cajal y al Grupo Biología y Evolución de Microorganismos del IRYCIS, ha llevado a cabo el estudio más completo hasta la fecha sobre variantes del VIH-1 en
población pediátrica, adolescente y adulta en Kinshasa (RD del Congo).
Publicado en la revista 'Scientifics Report', el trabajo cuenta con la colaboración del grupo dirigido por el jefe de Sección Virología del Servicio de Microbiología del hospital, Juan Carlos Galán, y del doctor de la Clínica Universidad de Navarra, Gabriel Reina, y clínicos del Hospital de Monkole de Kinshasa (República Democrática del Congo, RD Congo) encabezados por el doctor Adolphe Ndarabu.
Esta investigación supone el análisis epidemiológico molecular más completo que se haya publicado hasta la fecha sobre las variantes del VIH-1 que infectan a población pediátrica, adolescente y adulta en Kinshasa, origen de la pandemia del VIH-1.
Para ello se ha realizado una investigación exhaustiva analizando la diversidad de variantes del VIH-1 en 2.806 niños, adolescentes y adultos con VIH en este país africano mediante reconstrucciones filogenéticas y análisis bioinformáticos en todas las secuencias de virus en la región codificante de las principales dianas terapéuticas disponibles en personas infectadas en ese país.
Esto incluía nuevas secuencias virales que el grupo generó a partir de nuevas muestras de sangre seca (tomadas de 165 personas infectadas en Kinshasa en los últimos años (2016-2018). Así, el trabajo aporta los datos más recientes de las variantes del VIH-1 en la RD del Congo y sus tendencias temporales desde la primera secuencia disponible en el país tomada en una muestra recuperada en 1976 hasta la última en 2018, así como en Kinshasa, su capital, de 1983 a 2018.
También se analizaron eventos de recombinación y se identificaron grupos de transmisión reciente en la cohorte de estudio. Los estudios de vigilancia de la epidemiología molecular del VIH-1 son importantes a nivel mundial y de interés en cualquier entorno, si bien son aún más interesantes en un área con una alta diversidad viral, origen de la pandemia de VIH-1, donde el virus ha estado circulando durante más tiempo y podrían surgir nuevas variantes más patógenas o transmisibles.
Actualmente se han descrito más de 133 variantes del VIH en base a su homología genética, divididas en tipos, grupos, subtipos, sub- subtipos, y recombinantes circulantes (CRF) y únicos (URF). Por eso el trabajo se centró en estudiar la distribución temporal de cada una de las variantes del VIH-1 en el gen pol y la diversidad genética viral en el país y en Kinshasa desde el principio de la pandemia hasta la actualidad.
Para ello se compararon las variantes virales en las 165 nuevas secuencias generadas por el equipo de trabajo a partir de DBS tomados entre 2016 -2018 en Kinshasa con las variantes reclasificadas por el equipo investigador a partir de las 2.641 secuencias pol depositadas en la base de datos de Los Álamos (LANL) por otros autores hasta la fecha de estudio.
Estas últimas habían sido tomadas en muestras de pacientes con VIH de la RD Congo de 1976 -2012 y en Kinshasa de 1983-2008. Se reclasificaron previamente las variantes virales en todas las secuencias del VIH depositadas en LANL antes de 2016 con nuevos análisis filogenéticos para incluir las nuevas variantes del VIH ¡-1 identificadas en los años más recientes.
De 2016 -2018 los principales subtipos que circulaban en el país fueron el A (26,7%), G (9,7%) y C (7,3%). Los recombinantes entre subtipos representaron un tercio de las infecciones, siendo el 12,7% CRF y 23,6% URF (recombinantes más complejos). Se identificó el primer recombinante CRF47-BF informado en África y 4 grupos de transmisión, 3 de ellos recientes.
También se observó un aumento significativo del subtipo A y del subtipo F1 en Kinshasa entre 2016 -2018, así como una reducción significativa del subtipo A1 y del subtipo D, en comparación con variantes que circulaban en esa ciudad de 1983 a 2008.
Este trabajo proporciona información "única y actualizada" sobre la epidemiología molecular del VIH -1 en la RD del Congo, y sobre las variantes del VI H -1 que circulan actualmente en Kinshasa. También presenta una revisión completa de las tendencias temporales de los subtipos, y recombinantes CRF y URF en ese país durante 43 años, proporcionando los datos más amplios sobre niños y adolescentes en toda la historia de la epidemia en el país.
"Nuestro estudio refuerza el uso de sangre seca como un tipo de muestra útil y alternativa a la sangre completa o plasma en estudios de vigilancia epidemiológica molecular del VIH en países o entornos con limitaciones para la toma, almacenamiento o transporte de sangre", ha zanjado la doctora Holguín.
