Publicado 24/06/2021 18:03CET

Desarrollan un método de bajo coste para encontrar nuevas variantes del coronavirus

Archivo - Recreación 3D de la proteína spike del virus SARS-CoV-2./ National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Archivo - Recreación 3D de la proteína spike del virus SARS-CoV-2./ National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) - NIAID - Archivo

MADRID, 24 Jun. (EUROPA PRESS) -

Investigadores del Karolinska Institutet de Suecia han desarrollado una tecnología para la vigilancia rentable de la propagación mundial de nuevas variantes del SARS-CoV-2, el virus que causa la COVID-19.

Desde el inicio de la pandemia, se han secuenciado miles de genomas virales para reconstruir la evolución y la propagación mundial del coronavirus. Esto es importante para identificar variantes especialmente preocupantes que son más contagiosas, patógenas o resistentes a las vacunas existentes.

Para la vigilancia global del genoma del SARS-CoV-2, es crucial secuenciar y analizar muchas muestras de forma rentable. Por ello, los investigadores han desarrollado un nuevo método, denominado 'COVseq', que puede utilizarse para la vigilancia del genoma viral a escala masiva y a bajo coste.

En primer lugar, se crean muchas copias del genoma viral mediante la llamada PCR. A continuación, las muestras se etiquetan y se agrupan en una misma biblioteca de secuenciación, utilizando un método anterior y adaptado ahora para el análisis del SARS-CoV-2.

"Al realizar las reacciones en volúmenes muy pequeños y agrupar cientos de muestras en la misma biblioteca de secuenciación, podemos secuenciar potencialmente miles de genomas virales por semana a un coste inferior a 15 dólares por muestra", explica Ning Zhang, uno de los autores de la investigación, que se ha publicado en la revista 'Nature Communications'.

Los análisis comparativos de 29 muestras positivas al SARS-CoV-2 revelaron que 'COVseq' tenía una capacidad similar a la del método estándar para identificar pequeños cambios en el genoma. Los análisis de 245 muestras adicionales mostraron que 'COVseq' también tenía una gran capacidad para detectar variantes emergentes de coronavirus de potencial interés. La principal ventaja de 'COVseq' sobre los métodos existentes es su rentabilidad.

"Nuestro económico método podría utilizarse inmediatamente para la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 por parte de los organismos de salud pública y también podría adaptarse fácilmente a otros virus de ARN, como los de la gripe y el dengue", afirma Nicola Crosetto, último autor del artículo.