BARCELONA, 26 Oct. (EUROPA PRESS) -
Investigadores del grupo de Genómica Biomédica de la Universitat Pompeu Fabra (UPF) y del Instituto Hospital del Mar de Investigaciones Médica (Imim) han creado una página web abierta a la comunidad científica para diseñar paneles de secuenciación para cáncer.
La herramienta, llamada 'OncoPad' y publicada en la 'Genome Medicine', busca alteraciones del ADN del tumor del paciente --mutaciones--, que puedan tener un valor diagnóstico, pronóstico o terapéutico para la enfermedad, ha informado el centro este miércoles en un comunicado.
Para poder identificar estas mutaciones se debe secuenciar el ADN del tumor, ya sea abarcando todo su genoma, su exoma --la parte funcional del genoma-- o bien solo ciertos genes o regiones génicas, que se incluyen en paneles.
La secuenciación mediante paneles presenta ventajas respecto a la secuenciación de todo el genoma o exoma, y además de poseer un mejor coeficiente de coste/beneficio, los papeles detectan menos falsos positivos gracias a su mayor sensibilidad.
Mediante una interfaz sencilla e intuitiva, 'OncoPad' identifica qué genes o regiones son los mejores candidatos para el diseño de un papel específico, basándose en la asociación conocida de los genes a mecanismos de desarrollo del cáncer o respuesta a fármacos contra éste y maximizando su coeficiente de coste/beneficio.
