Publicado 04/05/2020 13:59CET

Coronavirus.- Una herramienta del CNB reúne información de todo el mundo sobre la estructura atómica del coronavirus

Estructura del trímero de la proteína que forma las espículas del virus SARS-CoV-2, obtenida por crio-microscopía electrónica
Estructura del trímero de la proteína que forma las espículas del virus SARS-CoV-2, obtenida por crio-microscopía electrónica - EQUIPO MCLELLAN - Archivo

MADRID, 4 May. (EUROPA PRESS) -

Investigadores del Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) han puesto a disposición de la comunidad científica una herramienta de computación que rastrea bases de datos y pone en común múltiples fuentes de información sobre el coronavirus SARS-CoV-2, causante de la pandemia de COVID-19. Este nueva herramienta de análisis, denominada '3DBionotes-Covid-19', integra toda esa información en un entorno interactivo tridimensional a nivel atómico.

Esta nueva aplicación pone de manifiesto el papel esencial de las infraestructuras de investigación del Foro Estratégico Europeo (ESFRI) y de la participación española en ellas, puesto que su desarrollo nace de la confluencia en el CNB-CSIC de dos de estas grandes infraestructuras, Instruct (en el marco de la Biología Estructural) y ELIXIR (en Bioinformática), de las que España es socio.

La aplicación se encuentra disponible tanto desde el CNB-CSIC como desde los nodos españoles de Instruct y de Elixir.

"3DBionotes-Covid-19' accede a bases de datos donde se encuentran diversos modelos atómicos de las proteínas virales (experimentales o sugeridos computacionalmente), al mismo tiempo que a múltiples bases de datos sobre características de las proteínas que participan en estos modelos atómicos", explica el profesor del CSIC José María Carazo, a cargo de este proyecto.

El objetivo, según Carazo, es que el investigador siempre pueda "navegar" entre estructuras y características, pudiendo hacer interactivamente minería de datos en un espacio complejo y multidimensional.

Aunque, naturalmente, la mayor parte de la búsqueda de información se realiza de forma automática, el caso de COVID-19 es tan singular que los investigadores del CNB-CSIC han tenido que integrar de forma manual información contenida en archivos diversos, como los generados por el Centro Nacional de Datos Genómicos Chino.

'3DBionotes-Covid-19' también contiene información sobre experimentos de unión entre proteínas virales y pequeñas moléculas que puedan ser, en el futuro, precursores de los antivirales.

"Lo que pretendemos, al crear '3DBionotes-Covid-19' es ayudar a la comunidad científica internacional a entender mejor toda la información sobre COVID-19 que se está generando mundialmente a un ritmo vertiginoso --asegura Carazo--. Especialmente, aquella que solo se comprende en su integridad si se relaciona con la estructura atómica de sus componentes. En otras palabras, '3DBionotes-Covid-19' reducirá el riesgo de generar información y no darnos cuenta de lo que significa, ayudándonos a interpretarla en su contexto estructural".