MADRID 2 Nov. (EUROPA PRESS) -
La Unidad de Bioestadística y Bioinformática de IMDEA Alimentación ha realizado un estudio que a dado lugar al desarrollo de un modelo quimioinformático que facilita el diseño de moléculas capaces de controlar el funcionamiento de los metabolitos -sustancias producidas por el organismo y la microbiota presentes en múltiples procesos biológicos críticos-, los cuales aparecen alterados ante enfermedades como las infecciones gastrointestinales, la colitis ulcerosa, las infecciones gastrointestinales, la enfermedad de Crohn, la diverticulitis y el cáncer de colon.
Estas moléculas así diseñadas, análogas a los metabolitos cuyos niveles son modificados cuando aparece la enfermedad, abren la puerta a una nueva modalidad de fármacos y de los denominados nutracéuticos, moléculas que actuarían preventivamente en la salud al controlar la composición de la flora intestinal.
El trabajo, que acaba de ser publicado en la revista científica 'Journal of Cheminformatics', está liderado por Gonzalo Colmenarejo, junto a Alberto Gil-Pichardo y Andrés SánchezRuiz, de la Unidad de Bioestadística y Bioinformática. Su investigación facilita el diseño de nuevas moléculas miméticas de metabolitos del microbioma intestinal que podrían actuar como tratamientos farmacológicos, al corregir las funciones alteradas en estas enfermedades, o como nutracéuticos de forma preventiva, permitiendo el control efectivo de las poblaciones bacterianas que influyen en la aparición de la obesidad, la diabetes o enfermedades cardiometabólicas.
Mediante herramientas quimioinformáticas y de ciencia de datos, los investigadores han analizado cerca de 6.000 metabolitos intestinales y los han comparado con otra base de datos de 1.400 fármacos orales de acción sistémica, es decir, que se distribuyen por el torrente sanguíneo y llegan a todo el cuerpo.
Tal como expone el doctor Gonzalo Colmenarejo, con la investigación se han encontrado patrones estructurales y fisicoquímicos muy diferentes al comparar tres grupos de moléculas: los fármacos habituales de acción sistémica, los metabolitos que permanecen en el intestino y los que pueden atravesar el intestino para llegar al torrente sanguíneo.
"Una de las mayores posibilidades de estos nuevos fármacos y nutracéuticos es que sus efectos secundarios podrían estar reducidos si se diseñaran de forma que permanecieran en el intestino", apunta el responsable de la Unidad de Bioestadística y Bioinformática en IMDEA Alimentación.
En este sentido, los científicos han desarrollado y validado un modelo de aprendizaje automático (Machine Learning), del tipo SuperLearner, que permite predecir la permanencia intestinal de un compuesto químico en base a su estructura. Este modelo, que ahora los autores han hecho público, servirá para el diseño de fármacos y nutracéuticos dirigidos al intestino.
"Los fármacos sistémicos tienen grandes problemas de desarrollo, porque al circular por todo el cuerpo es muy difícil evitar que no alteren uno o más de los múltiples procesos biológicos que se dan, resultando en efectos secundarios indeseados", indica Colmenarejo.
Con el diseño del compuesto para permanecer en el intestino, la aparición de problemas de distribución y toxicidad se reducirían puesto que la vía de administración sería oral, pero con un acceso mucho más específico al receptor biológico localizado en el intestino.
