Masiva base de datos digital

Diseñan una base de datos de genes relacionados con enfermedades que muestra potenciales terapias farmacológicas

Actualizado 07/10/2014 12:06:29 CET

MADRID, 13 Oct. (EUROPA PRESS) -

Investigadores de la Escuela Universitaria de Medicina de Washington en St. Louis, en Estados Unidos, han creado una masiva base de datos digital que empareja miles de genes relacionados con el cáncer y otras enfermedades con medicamentos que se dirigen a los genes. Algunos de los fármacos están aprobados por la agencia norteamericana del medicamento (FDA, en sus siglas en inglés) mientras que otros se encuentran en ensayos clínicos o simplemente entran en fase de desarrollo.

La base de datos fue ideada por los hermanos gemelos Obi y Malaquías Griffith, cuyo interés en el emparejamiento de los medicamentos con los genes es tanto personal como científico. Su madre murió de cáncer de mama hace 17 años, pocas semanas antes de su graduación de educación secundaria. "Queríamos crear una base de datos completa que sea fácil de usar, algo en la línea de un motor de búsqueda de Google para los genes vinculados a enfermedades", explicó Malaquías Griffith, instructor de la investigación en genética.

"A medida que avanzamos hacia la medicina personalizada, hay mucho interés en saber si los medicamentos pueden dirigirse a genes mutados en pacientes particulares o en ciertas enfermedades, como el cáncer de pulmón o de mama. Pero no ha sido un camino fácil encontrar esa información", agregó el coautor de la base de datos, publicada en la edición digital de este domingo de 'Nature Methods'.

La base de datos se inclina fuertemente hacia los genes del cáncer, pero también incluye genes implicados en la enfermedad de Alzheimer, patologías del corazón, diabetes y muchas otras. Los hermanos Griffith crearon la base de datos con un equipo de científicos del Instituto del Genoma en la Universidad Washington en St. Louis.

Esta herramienta fácil de buscar y está dirigida a investigadores y médicos- científicos que quieren saber si los errores en los genes vinculados a patoogías, identificados a través de la secuenciación del genoma o de otros métodos, podrían ser dirigidos con los tratamientos farmacológicos existentes.

"El desarrollo de la base de datos fue una labor de amor para los Griffith", dijo el autor principal, Richard K. Wilson, director del Instituto del Genoma. "Hay una profundidad increíble en este recurso, que será de gran valor para los investigadores que trabajan para diseñar mejores opciones de tratamiento para los pacientes", agregó.

Wilson y sus colegas advierten que la base de datos es para fines de investigación y no recomienda tratamientos, puesto que su propósito principal es promover la investigación clínica destinada a tratar más eficazmente las enfermedades. "Esta base de datos nos lleva un paso más cerca de ese objetivo --destacó Malaquías Griffith--. Es un recurso muy rico y estamos muy contentos de que esté disponible para la comunidad científica".

14.000 INTERACCIONES DE FÁRMACOS

La base de datos, que costó varios años desarrollarla, está disponible al público y es de uso gratuito. Incluye más de 14.000 interacciones de drogas con genes relacionadas con 2.600 genes y 6.300 medicamentos que se dirigen a los genes. Otros 6.700 genes están en la base de datos, por lo que potencialmente podrían ser objeto de futuros fármacos.

Los hermanos Griffith son expertos en Bioinformática, un campo de la ciencia que integra la Biología y la Informática y trata de analizar grandes cantidades de datos. La nueva base de datos reúne información de 15 bases de datos a disposición del público en Estados Unidos, Canadá, Europa y Asia.

Los usuarios pueden introducir el nombre de un solo gen o listas de muchos genes para encontrar fármacos dirigidos a esos genes. La búsqueda proporciona los nombres de los fármacos dirigidos a cada gen y detalles de si el fármaco es un inhibidor, un anticuerpo, una vacuna u otro tipo. Los resultados también señalan la fuente de la información en la que los usuarios pueden profundizar, si así lo desean.

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